Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SmagpQ99KC7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SmagpQ99KC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SmagpQ99KC7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SmagpQ99KC7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SmagpQ99KC7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SmagpQ99KC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SmagpQ99KC7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmagpQ99KC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms