Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tm4sf4Q91XD3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tm4sf4Q91XD3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Tm4sf4Q91XD3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tm4sf4Q91XD3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tm4sf4Q91XD3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tm4sf4Q91XD3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tm4sf4Q91XD3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tm4sf4Q91XD3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tm4sf4Q91XD3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Tm4sf4Q91XD3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Tm4sf4Q91XD3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tm4sf4Q91XD3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tm4sf4Q91XD3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tm4sf4Q91XD3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tm4sf4Q91XD3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tm4sf4Q91XD3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tm4sf4Q91XD3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tm4sf4Q91XD3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tm4sf4Q91XD3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tm4sf4Q91XD3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tm4sf4Q91XD3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tm4sf4Q91XD3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tm4sf4Q91XD3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tm4sf4Q91XD3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tm4sf4Q91XD3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tm4sf4Q91XD3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tm4sf4Q91XD3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tm4sf4Q91XD3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Tm4sf4Q91XD3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tm4sf4Q91XD3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tm4sf4Q91XD3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Tm4sf4Q91XD3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tm4sf4Q91XD3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tm4sf4Q91XD3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tm4sf4Q91XD3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tm4sf4Q91XD3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tm4sf4Q91XD3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tm4sf4Q91XD3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tm4sf4Q91XD3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tm4sf4Q91XD3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tm4sf4Q91XD3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tm4sf4Q91XD3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tm4sf4Q91XD3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tm4sf4Q91XD3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 567.8 ms