Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmcd1Q8VEE1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmcd1Q8VEE1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmcd1Q8VEE1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmcd1Q8VEE1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmcd1Q8VEE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmcd1Q8VEE1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmcd1Q8VEE1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmcd1Q8VEE1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmcd1Q8VEE1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmcd1Q8VEE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lmcd1Q8VEE1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmcd1Q8VEE1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmcd1Q8VEE1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmcd1Q8VEE1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmcd1Q8VEE1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmcd1Q8VEE1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmcd1Q8VEE1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmcd1Q8VEE1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmcd1Q8VEE1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmcd1Q8VEE1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmcd1Q8VEE1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmcd1Q8VEE1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmcd1Q8VEE1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmcd1Q8VEE1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmcd1Q8VEE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmcd1Q8VEE1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmcd1Q8VEE1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmcd1Q8VEE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmcd1Q8VEE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmcd1Q8VEE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmcd1Q8VEE1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmcd1Q8VEE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmcd1Q8VEE1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmcd1Q8VEE1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmcd1Q8VEE1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmcd1Q8VEE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmcd1Q8VEE1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmcd1Q8VEE1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmcd1Q8VEE1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmcd1Q8VEE1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lmcd1Q8VEE1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmcd1Q8VEE1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmcd1Q8VEE1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmcd1Q8VEE1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmcd1Q8VEE1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmcd1Q8VEE1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmcd1Q8VEE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms