Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Krt79Q8VED5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Krt79Q8VED5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Krt79Q8VED5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Krt79Q8VED5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Krt79Q8VED5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Krt79Q8VED5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Krt79Q8VED5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krt79Q8VED5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krt79Q8VED5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Krt79Q8VED5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Krt79Q8VED5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Krt79Q8VED5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Krt79Q8VED5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Krt79Q8VED5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Krt79Q8VED5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Krt79Q8VED5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Krt79Q8VED5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Krt79Q8VED5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Krt79Q8VED5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Krt79Q8VED5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Krt79Q8VED5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Krt79Q8VED5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Krt79Q8VED5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Krt79Q8VED5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Krt79Q8VED5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Krt79Q8VED5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Krt79Q8VED5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Krt79Q8VED5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Krt79Q8VED5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krt79Q8VED5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt79Q8VED5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt79Q8VED5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Krt79Q8VED5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Krt79Q8VED5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krt79Q8VED5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Krt79Q8VED5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Krt79Q8VED5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Krt79Q8VED5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt79Q8VED5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt79Q8VED5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt79Q8VED5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt79Q8VED5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt79Q8VED5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt79Q8VED5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt79Q8VED5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms