Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Cul7Q8VE73 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cul7Q8VE73 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cul7Q8VE73 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Cul7Q8VE73 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
Cul7Q8VE73 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Cul7Q8VE73 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Cul7Q8VE73 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Cul7Q8VE73 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Cul7Q8VE73 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Cul7Q8VE73 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cul7Q8VE73 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Cul7Q8VE73 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Cul7Q8VE73 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Cul7Q8VE73 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Cul7Q8VE73 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Cul7Q8VE73 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Cul7Q8VE73 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Cul7Q8VE73 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Cul7Q8VE73 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Cul7Q8VE73 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
Cul7Q8VE73 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Cul7Q8VE73 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Cul7Q8VE73 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Cul7Q8VE73 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Cul7Q8VE73 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Cul7Q8VE73 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cul7Q8VE73 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Cul7Q8VE73 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Cul7Q8VE73 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Cul7Q8VE73 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Cul7Q8VE73 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Cul7Q8VE73 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Cul7Q8VE73 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Cul7Q8VE73 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Cul7Q8VE73 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Cul7Q8VE73 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Cul7Q8VE73 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Cul7Q8VE73 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Cul7Q8VE73 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Cul7Q8VE73 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Cul7Q8VE73 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Cul7Q8VE73 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Cul7Q8VE73 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Cul7Q8VE73 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Cul7Q8VE73 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Cul7Q8VE73 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Cul7Q8VE73 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Cul7Q8VE73 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Cul7Q8VE73 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Cul7Q8VE73 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Cul7Q8VE73 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Cul7Q8VE73 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Cul7Q8VE73 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Cul7Q8VE73 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Cul7Q8VE73 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Cul7Q8VE73 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Cul7Q8VE73 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Cul7Q8VE73 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cul7Q8VE73 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cul7Q8VE73 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cul7Q8VE73 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Cul7Q8VE73 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Cul7Q8VE73 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Cul7Q8VE73 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Cul7Q8VE73 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Cul7Q8VE73 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Cul7Q8VE73 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Cul7Q8VE73 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Cul7Q8VE73 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Cul7Q8VE73 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cul7Q8VE73 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cul7Q8VE73 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Cul7Q8VE73 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Cul7Q8VE73 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Cul7Q8VE73 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Cul7Q8VE73 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Cul7Q8VE73 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Cul7Q8VE73 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Cul7Q8VE73 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Cul7Q8VE73 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms