Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan10Q8VCF5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan10Q8VCF5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan10Q8VCF5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan10Q8VCF5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan10Q8VCF5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan10Q8VCF5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan10Q8VCF5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan10Q8VCF5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan10Q8VCF5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan10Q8VCF5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan10Q8VCF5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan10Q8VCF5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan10Q8VCF5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan10Q8VCF5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan10Q8VCF5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan10Q8VCF5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms