Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC48

Pex12, Peroxisome assembly protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex12Q8VC48 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex12Q8VC48 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex12Q8VC48 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex12Q8VC48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex12Q8VC48 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex12Q8VC48 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex12Q8VC48 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Pex12Q8VC48 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pex12Q8VC48 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pex12Q8VC48 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pex12Q8VC48 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pex12Q8VC48 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pex12Q8VC48 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pex12Q8VC48 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pex12Q8VC48 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex12Q8VC48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex12Q8VC48 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex12Q8VC48 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex12Q8VC48 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex12Q8VC48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex12Q8VC48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pex12Q8VC48 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex12Q8VC48 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex12Q8VC48 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex12Q8VC48 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex12Q8VC48 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pex12Q8VC48 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pex12Q8VC48 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pex12Q8VC48 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pex12Q8VC48 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pex12Q8VC48 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pex12Q8VC48 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pex12Q8VC48 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pex12Q8VC48 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pex12Q8VC48 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pex12Q8VC48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms