Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap2Q8VC34 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap2Q8VC34 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap2Q8VC34 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap2Q8VC34 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap2Q8VC34 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap2Q8VC34 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap2Q8VC34 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap2Q8VC34 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap2Q8VC34 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap2Q8VC34 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap2Q8VC34 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap2Q8VC34 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpap2Q8VC34 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap2Q8VC34 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpap2Q8VC34 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpap2Q8VC34 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rpap2Q8VC34 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rpap2Q8VC34 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap2Q8VC34 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap2Q8VC34 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap2Q8VC34 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap2Q8VC34 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap2Q8VC34 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpap2Q8VC34 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpap2Q8VC34 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap2Q8VC34 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap2Q8VC34 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap2Q8VC34 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap2Q8VC34 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpap2Q8VC34 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap2Q8VC34 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpap2Q8VC34 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpap2Q8VC34 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpap2Q8VC34 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpap2Q8VC34 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpap2Q8VC34 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpap2Q8VC34 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpap2Q8VC34 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpap2Q8VC34 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap2Q8VC34 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap2Q8VC34 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpap2Q8VC34 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap2Q8VC34 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap2Q8VC34 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap2Q8VC34 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap2Q8VC34 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpap2Q8VC34 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap2Q8VC34 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms