Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clptm1Q8VBZ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clptm1Q8VBZ3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clptm1Q8VBZ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clptm1Q8VBZ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clptm1Q8VBZ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clptm1Q8VBZ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clptm1Q8VBZ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clptm1Q8VBZ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clptm1Q8VBZ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clptm1Q8VBZ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clptm1Q8VBZ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clptm1Q8VBZ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clptm1Q8VBZ3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clptm1Q8VBZ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clptm1Q8VBZ3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Clptm1Q8VBZ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clptm1Q8VBZ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clptm1Q8VBZ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clptm1Q8VBZ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clptm1Q8VBZ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clptm1Q8VBZ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clptm1Q8VBZ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms