Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc59Q8R2N0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc59Q8R2N0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc59Q8R2N0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc59Q8R2N0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc59Q8R2N0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc59Q8R2N0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc59Q8R2N0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc59Q8R2N0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc59Q8R2N0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc59Q8R2N0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc59Q8R2N0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc59Q8R2N0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc59Q8R2N0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc59Q8R2N0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc59Q8R2N0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc59Q8R2N0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc59Q8R2N0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc59Q8R2N0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc59Q8R2N0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms