Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube2q2Q8K2Z8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube2q2Q8K2Z8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube2q2Q8K2Z8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube2q2Q8K2Z8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ube2q2Q8K2Z8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube2q2Q8K2Z8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube2q2Q8K2Z8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube2q2Q8K2Z8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2q2Q8K2Z8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube2q2Q8K2Z8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ube2q2Q8K2Z8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube2q2Q8K2Z8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube2q2Q8K2Z8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2q2Q8K2Z8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2q2Q8K2Z8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms