Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgap29Q8CGF1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgap29Q8CGF1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgap29Q8CGF1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgap29Q8CGF1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgap29Q8CGF1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgap29Q8CGF1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgap29Q8CGF1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap29Q8CGF1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap29Q8CGF1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap29Q8CGF1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap29Q8CGF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap29Q8CGF1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgap29Q8CGF1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap29Q8CGF1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap29Q8CGF1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgap29Q8CGF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgap29Q8CGF1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgap29Q8CGF1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap29Q8CGF1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap29Q8CGF1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap29Q8CGF1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap29Q8CGF1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms