Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc38Q8CDN8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc38Q8CDN8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc38Q8CDN8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc38Q8CDN8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc38Q8CDN8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc38Q8CDN8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc38Q8CDN8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc38Q8CDN8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc38Q8CDN8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc38Q8CDN8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc38Q8CDN8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc38Q8CDN8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc38Q8CDN8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc38Q8CDN8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc38Q8CDN8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc38Q8CDN8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc38Q8CDN8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc38Q8CDN8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc38Q8CDN8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc38Q8CDN8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc38Q8CDN8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc38Q8CDN8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc38Q8CDN8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc38Q8CDN8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc38Q8CDN8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc38Q8CDN8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc38Q8CDN8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc38Q8CDN8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc38Q8CDN8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc38Q8CDN8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc38Q8CDN8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc38Q8CDN8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc38Q8CDN8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc38Q8CDN8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc38Q8CDN8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc38Q8CDN8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc38Q8CDN8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc38Q8CDN8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc38Q8CDN8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc38Q8CDN8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc38Q8CDN8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc38Q8CDN8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc38Q8CDN8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc38Q8CDN8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms