Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa22Q8C1N8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa22Q8C1N8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa22Q8C1N8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa22Q8C1N8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa22Q8C1N8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa22Q8C1N8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.7 ms