Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc30Q8BVF4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc30Q8BVF4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms