Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc30Q8BVF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc30Q8BVF4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc30Q8BVF4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc30Q8BVF4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc30Q8BVF4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc30Q8BVF4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc30Q8BVF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc30Q8BVF4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc30Q8BVF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc30Q8BVF4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc30Q8BVF4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc30Q8BVF4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc30Q8BVF4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms