Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubash3bQ8BGG7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubash3bQ8BGG7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubash3bQ8BGG7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubash3bQ8BGG7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubash3bQ8BGG7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubash3bQ8BGG7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubash3bQ8BGG7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubash3bQ8BGG7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubash3bQ8BGG7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubash3bQ8BGG7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubash3bQ8BGG7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubash3bQ8BGG7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubash3bQ8BGG7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubash3bQ8BGG7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.4 ms