Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AW551984Q8BGF0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AW551984Q8BGF0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW551984Q8BGF0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AW551984Q8BGF0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AW551984Q8BGF0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AW551984Q8BGF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AW551984Q8BGF0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AW551984Q8BGF0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AW551984Q8BGF0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AW551984Q8BGF0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AW551984Q8BGF0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AW551984Q8BGF0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AW551984Q8BGF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AW551984Q8BGF0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AW551984Q8BGF0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AW551984Q8BGF0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AW551984Q8BGF0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AW551984Q8BGF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AW551984Q8BGF0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AW551984Q8BGF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AW551984Q8BGF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AW551984Q8BGF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AW551984Q8BGF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AW551984Q8BGF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AW551984Q8BGF0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms