Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim65Q8BFW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim65Q8BFW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim65Q8BFW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim65Q8BFW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim65Q8BFW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim65Q8BFW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim65Q8BFW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim65Q8BFW4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim65Q8BFW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim65Q8BFW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim65Q8BFW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim65Q8BFW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim65Q8BFW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim65Q8BFW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim65Q8BFW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim65Q8BFW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim65Q8BFW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim65Q8BFW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim65Q8BFW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim65Q8BFW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim65Q8BFW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim65Q8BFW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim65Q8BFW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim65Q8BFW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim65Q8BFW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim65Q8BFW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim65Q8BFW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim65Q8BFW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim65Q8BFW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim65Q8BFW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim65Q8BFW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim65Q8BFW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim65Q8BFW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim65Q8BFW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim65Q8BFW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim65Q8BFW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim65Q8BFW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim65Q8BFW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim65Q8BFW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim65Q8BFW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim65Q8BFW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim65Q8BFW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim65Q8BFW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms