Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y17

Llgl1, Lethal(2) giant larvae protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llgl1Q80Y17 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Llgl1Q80Y17 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Llgl1Q80Y17 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Llgl1Q80Y17 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Llgl1Q80Y17 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Llgl1Q80Y17 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Llgl1Q80Y17 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Llgl1Q80Y17 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Llgl1Q80Y17 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Llgl1Q80Y17 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Llgl1Q80Y17 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Llgl1Q80Y17 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Llgl1Q80Y17 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Llgl1Q80Y17 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Llgl1Q80Y17 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Llgl1Q80Y17 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Llgl1Q80Y17 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Llgl1Q80Y17 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Llgl1Q80Y17 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Llgl1Q80Y17 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Llgl1Q80Y17 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Llgl1Q80Y17 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Llgl1Q80Y17 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms