Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thnsl2Q80W22 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thnsl2Q80W22 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thnsl2Q80W22 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thnsl2Q80W22 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thnsl2Q80W22 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thnsl2Q80W22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thnsl2Q80W22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thnsl2Q80W22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thnsl2Q80W22 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thnsl2Q80W22 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Thnsl2Q80W22 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thnsl2Q80W22 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thnsl2Q80W22 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms