Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sdccag8Q80UF4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sdccag8Q80UF4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sdccag8Q80UF4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sdccag8Q80UF4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sdccag8Q80UF4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sdccag8Q80UF4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sdccag8Q80UF4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sdccag8Q80UF4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdccag8Q80UF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sdccag8Q80UF4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sdccag8Q80UF4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sdccag8Q80UF4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sdccag8Q80UF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sdccag8Q80UF4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sdccag8Q80UF4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sdccag8Q80UF4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sdccag8Q80UF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sdccag8Q80UF4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sdccag8Q80UF4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sdccag8Q80UF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sdccag8Q80UF4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sdccag8Q80UF4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sdccag8Q80UF4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sdccag8Q80UF4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sdccag8Q80UF4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sdccag8Q80UF4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sdccag8Q80UF4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sdccag8Q80UF4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sdccag8Q80UF4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sdccag8Q80UF4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sdccag8Q80UF4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sdccag8Q80UF4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sdccag8Q80UF4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms