Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Atf7ipQ7TT18 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Atf7ipQ7TT18 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Atf7ipQ7TT18 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Atf7ipQ7TT18 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atf7ipQ7TT18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atf7ipQ7TT18 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atf7ipQ7TT18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atf7ipQ7TT18 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Atf7ipQ7TT18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Atf7ipQ7TT18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Atf7ipQ7TT18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Atf7ipQ7TT18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Atf7ipQ7TT18 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Atf7ipQ7TT18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Atf7ipQ7TT18 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Atf7ipQ7TT18 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Atf7ipQ7TT18 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Atf7ipQ7TT18 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atf7ipQ7TT18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atf7ipQ7TT18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atf7ipQ7TT18 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atf7ipQ7TT18 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atf7ipQ7TT18 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atf7ipQ7TT18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Atf7ipQ7TT18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atf7ipQ7TT18 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atf7ipQ7TT18 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atf7ipQ7TT18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atf7ipQ7TT18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atf7ipQ7TT18 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atf7ipQ7TT18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atf7ipQ7TT18 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atf7ipQ7TT18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atf7ipQ7TT18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atf7ipQ7TT18 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atf7ipQ7TT18 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atf7ipQ7TT18 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atf7ipQ7TT18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf7ipQ7TT18 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atf7ipQ7TT18 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atf7ipQ7TT18 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Atf7ipQ7TT18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atf7ipQ7TT18 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atf7ipQ7TT18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atf7ipQ7TT18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atf7ipQ7TT18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atf7ipQ7TT18 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atf7ipQ7TT18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atf7ipQ7TT18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atf7ipQ7TT18 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atf7ipQ7TT18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Atf7ipQ7TT18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atf7ipQ7TT18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atf7ipQ7TT18 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atf7ipQ7TT18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Atf7ipQ7TT18 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Atf7ipQ7TT18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms