Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nphp3Q7TNH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Nphp3Q7TNH6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nphp3Q7TNH6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nphp3Q7TNH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nphp3Q7TNH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nphp3Q7TNH6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Nphp3Q7TNH6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nphp3Q7TNH6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nphp3Q7TNH6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp3Q7TNH6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp3Q7TNH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp3Q7TNH6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nphp3Q7TNH6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nphp3Q7TNH6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nphp3Q7TNH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Nphp3Q7TNH6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nphp3Q7TNH6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nphp3Q7TNH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nphp3Q7TNH6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nphp3Q7TNH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nphp3Q7TNH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nphp3Q7TNH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Nphp3Q7TNH6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nphp3Q7TNH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nphp3Q7TNH6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Nphp3Q7TNH6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms