Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mindy1Q76LS9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mindy1Q76LS9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mindy1Q76LS9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mindy1Q76LS9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mindy1Q76LS9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mindy1Q76LS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Mindy1Q76LS9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mindy1Q76LS9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mindy1Q76LS9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Mindy1Q76LS9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mindy1Q76LS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mindy1Q76LS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mindy1Q76LS9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mindy1Q76LS9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mindy1Q76LS9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mindy1Q76LS9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mindy1Q76LS9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mindy1Q76LS9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mindy1Q76LS9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mindy1Q76LS9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mindy1Q76LS9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mindy1Q76LS9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mindy1Q76LS9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Mindy1Q76LS9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mindy1Q76LS9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mindy1Q76LS9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mindy1Q76LS9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Mindy1Q76LS9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mindy1Q76LS9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mindy1Q76LS9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms