Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmeff1Q6PFE7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmeff1Q6PFE7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmeff1Q6PFE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmeff1Q6PFE7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmeff1Q6PFE7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmeff1Q6PFE7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmeff1Q6PFE7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmeff1Q6PFE7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmeff1Q6PFE7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmeff1Q6PFE7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmeff1Q6PFE7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmeff1Q6PFE7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmeff1Q6PFE7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmeff1Q6PFE7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmeff1Q6PFE7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmeff1Q6PFE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmeff1Q6PFE7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmeff1Q6PFE7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmeff1Q6PFE7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmeff1Q6PFE7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmeff1Q6PFE7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms