Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Herc4Q6PAV2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Herc4Q6PAV2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Herc4Q6PAV2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Herc4Q6PAV2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Herc4Q6PAV2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Herc4Q6PAV2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Herc4Q6PAV2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Herc4Q6PAV2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Herc4Q6PAV2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Herc4Q6PAV2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Herc4Q6PAV2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Herc4Q6PAV2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Herc4Q6PAV2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Herc4Q6PAV2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Herc4Q6PAV2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Herc4Q6PAV2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Herc4Q6PAV2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Herc4Q6PAV2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Herc4Q6PAV2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Herc4Q6PAV2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Herc4Q6PAV2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Herc4Q6PAV2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Herc4Q6PAV2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Herc4Q6PAV2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Herc4Q6PAV2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Herc4Q6PAV2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Herc4Q6PAV2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Herc4Q6PAV2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Herc4Q6PAV2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Herc4Q6PAV2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Herc4Q6PAV2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Herc4Q6PAV2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Herc4Q6PAV2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Herc4Q6PAV2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Herc4Q6PAV2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Herc4Q6PAV2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Herc4Q6PAV2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms