Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rexo4Q6PAQ4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rexo4Q6PAQ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rexo4Q6PAQ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo4Q6PAQ4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo4Q6PAQ4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rexo4Q6PAQ4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms