Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stmnd1Q6P3A1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Stmnd1Q6P3A1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stmnd1Q6P3A1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stmnd1Q6P3A1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stmnd1Q6P3A1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stmnd1Q6P3A1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stmnd1Q6P3A1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stmnd1Q6P3A1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stmnd1Q6P3A1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stmnd1Q6P3A1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stmnd1Q6P3A1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stmnd1Q6P3A1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stmnd1Q6P3A1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stmnd1Q6P3A1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stmnd1Q6P3A1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stmnd1Q6P3A1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stmnd1Q6P3A1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stmnd1Q6P3A1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stmnd1Q6P3A1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stmnd1Q6P3A1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stmnd1Q6P3A1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stmnd1Q6P3A1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stmnd1Q6P3A1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stmnd1Q6P3A1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stmnd1Q6P3A1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms