Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gpbp1Q6NXH3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gpbp1Q6NXH3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gpbp1Q6NXH3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gpbp1Q6NXH3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gpbp1Q6NXH3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gpbp1Q6NXH3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gpbp1Q6NXH3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Gpbp1Q6NXH3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gpbp1Q6NXH3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gpbp1Q6NXH3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gpbp1Q6NXH3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gpbp1Q6NXH3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gpbp1Q6NXH3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpbp1Q6NXH3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Gpbp1Q6NXH3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gpbp1Q6NXH3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gpbp1Q6NXH3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpbp1Q6NXH3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gpbp1Q6NXH3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpbp1Q6NXH3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpbp1Q6NXH3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpbp1Q6NXH3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpbp1Q6NXH3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpbp1Q6NXH3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpbp1Q6NXH3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpbp1Q6NXH3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms