Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms