Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NipblQ6KCD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NipblQ6KCD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NipblQ6KCD5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NipblQ6KCD5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NipblQ6KCD5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NipblQ6KCD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NipblQ6KCD5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NipblQ6KCD5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NipblQ6KCD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 489.5 ms