Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80dQ66JY2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80dQ66JY2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ino80dQ66JY2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80dQ66JY2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80dQ66JY2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80dQ66JY2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80dQ66JY2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80dQ66JY2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80dQ66JY2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80dQ66JY2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80dQ66JY2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80dQ66JY2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80dQ66JY2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ino80dQ66JY2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ino80dQ66JY2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80dQ66JY2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80dQ66JY2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80dQ66JY2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80dQ66JY2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms