Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q66JV7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q66JV7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q66JV7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q66JV7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q66JV7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q66JV7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q66JV7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q66JV7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q66JV7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q66JV7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q66JV7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q66JV7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q66JV7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q66JV7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q66JV7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q66JV7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q66JV7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q66JV7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q66JV7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q66JV7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q66JV7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q66JV7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q66JV7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q66JV7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q66JV7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q66JV7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q66JV7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q66JV7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q66JV7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q66JV7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q66JV7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q66JV7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q66JV7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q66JV7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q66JV7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q66JV7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q66JV7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q66JV7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q66JV7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q66JV7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q66JV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q66JV7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Q66JV7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q66JV7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q66JV7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Q66JV7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q66JV7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q66JV7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q66JV7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q66JV7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q66JV7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q66JV7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q66JV7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q66JV7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q66JV7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Q66JV7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Q66JV7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Q66JV7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q66JV7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q66JV7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q66JV7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Q66JV7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q66JV7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Q66JV7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q66JV7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Q66JV7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q66JV7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q66JV7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q66JV7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q66JV7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q66JV7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Q66JV7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q66JV7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q66JV7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q66JV7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q66JV7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q66JV7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q66JV7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q66JV7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q66JV7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q66JV7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q66JV7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q66JV7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q66JV7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q66JV7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q66JV7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q66JV7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q66JV7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Q66JV7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Q66JV7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q66JV7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q66JV7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q66JV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q66JV7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q66JV7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q66JV7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q66JV7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q66JV7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q66JV7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms