Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Siglec1Q62230 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Siglec1Q62230 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Siglec1Q62230 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Siglec1Q62230 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Siglec1Q62230 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Siglec1Q62230 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Siglec1Q62230 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Siglec1Q62230 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Siglec1Q62230 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Siglec1Q62230 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Siglec1Q62230 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Siglec1Q62230 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Siglec1Q62230 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms