Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx3xQ62167 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx3xQ62167 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Ddx3xQ62167 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx3xQ62167 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx3xQ62167 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx3xQ62167 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx3xQ62167 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx3xQ62167 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx3xQ62167 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx3xQ62167 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx3xQ62167 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx3xQ62167 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx3xQ62167 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx3xQ62167 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ddx3xQ62167 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx3xQ62167 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx3xQ62167 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx3xQ62167 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddx3xQ62167 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddx3xQ62167 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddx3xQ62167 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddx3xQ62167 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms