Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcbp2Q61990 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcbp2Q61990 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcbp2Q61990 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcbp2Q61990 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp2Q61990 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp2Q61990 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp2Q61990 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp2Q61990 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcbp2Q61990 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcbp2Q61990 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcbp2Q61990 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcbp2Q61990 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcbp2Q61990 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcbp2Q61990 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcbp2Q61990 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcbp2Q61990 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcbp2Q61990 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms