Protein–RNA interactions for Protein: Q61268

Apoc4, Apolipoprotein C-IV, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc4Q61268 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc4Q61268 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc4Q61268 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc4Q61268 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc4Q61268 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc4Q61268 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoc4Q61268 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc4Q61268 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc4Q61268 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc4Q61268 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc4Q61268 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc4Q61268 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc4Q61268 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms