Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sim2Q61079 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sim2Q61079 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sim2Q61079 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sim2Q61079 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sim2Q61079 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sim2Q61079 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sim2Q61079 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sim2Q61079 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sim2Q61079 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sim2Q61079 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sim2Q61079 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sim2Q61079 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sim2Q61079 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sim2Q61079 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sim2Q61079 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sim2Q61079 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sim2Q61079 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sim2Q61079 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sim2Q61079 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sim2Q61079 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sim2Q61079 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sim2Q61079 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sim2Q61079 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sim2Q61079 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sim2Q61079 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sim2Q61079 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sim2Q61079 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sim2Q61079 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sim2Q61079 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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