Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usf1Q61069 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usf1Q61069 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usf1Q61069 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usf1Q61069 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usf1Q61069 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usf1Q61069 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usf1Q61069 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usf1Q61069 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usf1Q61069 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usf1Q61069 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usf1Q61069 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usf1Q61069 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usf1Q61069 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usf1Q61069 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usf1Q61069 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usf1Q61069 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usf1Q61069 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usf1Q61069 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usf1Q61069 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usf1Q61069 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usf1Q61069 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usf1Q61069 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usf1Q61069 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usf1Q61069 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usf1Q61069 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usf1Q61069 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usf1Q61069 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usf1Q61069 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usf1Q61069 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usf1Q61069 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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