Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cnot7Q60809 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cnot7Q60809 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnot7Q60809 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Cnot7Q60809 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cnot7Q60809 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cnot7Q60809 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cnot7Q60809 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cnot7Q60809 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cnot7Q60809 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Cnot7Q60809 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cnot7Q60809 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cnot7Q60809 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cnot7Q60809 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cnot7Q60809 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnot7Q60809 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnot7Q60809 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cnot7Q60809 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cnot7Q60809 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cnot7Q60809 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cnot7Q60809 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cnot7Q60809 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnot7Q60809 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnot7Q60809 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnot7Q60809 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnot7Q60809 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cnot7Q60809 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cnot7Q60809 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cnot7Q60809 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cnot7Q60809 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cnot7Q60809 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Cnot7Q60809 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cnot7Q60809 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnot7Q60809 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Cnot7Q60809 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnot7Q60809 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnot7Q60809 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cnot7Q60809 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnot7Q60809 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cnot7Q60809 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cnot7Q60809 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cnot7Q60809 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms