Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Atf3Q60765 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atf3Q60765 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atf3Q60765 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atf3Q60765 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Atf3Q60765 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Atf3Q60765 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atf3Q60765 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Atf3Q60765 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atf3Q60765 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atf3Q60765 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Atf3Q60765 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Atf3Q60765 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Atf3Q60765 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Atf3Q60765 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Atf3Q60765 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Atf3Q60765 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Atf3Q60765 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Atf3Q60765 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Atf3Q60765 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Atf3Q60765 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Atf3Q60765 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Atf3Q60765 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Atf3Q60765 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Atf3Q60765 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Atf3Q60765 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Atf3Q60765 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Atf3Q60765 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Atf3Q60765 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Atf3Q60765 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Atf3Q60765 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Atf3Q60765 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Atf3Q60765 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Atf3Q60765 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Atf3Q60765 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Atf3Q60765 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Atf3Q60765 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Atf3Q60765 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Atf3Q60765 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Atf3Q60765 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Atf3Q60765 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Atf3Q60765 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Atf3Q60765 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Atf3Q60765 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Atf3Q60765 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Atf3Q60765 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Atf3Q60765 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Atf3Q60765 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Atf3Q60765 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Atf3Q60765 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Atf3Q60765 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Atf3Q60765 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Atf3Q60765 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Atf3Q60765 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Atf3Q60765 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Atf3Q60765 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Atf3Q60765 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Atf3Q60765 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Atf3Q60765 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Atf3Q60765 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Atf3Q60765 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Atf3Q60765 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Atf3Q60765 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Atf3Q60765 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Atf3Q60765 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Atf3Q60765 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Atf3Q60765 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Atf3Q60765 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Atf3Q60765 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Atf3Q60765 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Atf3Q60765 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms