Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Epha1Q60750 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha1Q60750 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha1Q60750 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha1Q60750 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epha1Q60750 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Epha1Q60750 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Epha1Q60750 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epha1Q60750 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Epha1Q60750 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Epha1Q60750 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha1Q60750 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epha1Q60750 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Epha1Q60750 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha1Q60750 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha1Q60750 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha1Q60750 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha1Q60750 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha1Q60750 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Epha1Q60750 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epha1Q60750 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms