Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr2f1Q60632 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2f1Q60632 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2f1Q60632 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2f1Q60632 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2f1Q60632 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr2f1Q60632 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr2f1Q60632 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr2f1Q60632 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2f1Q60632 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr2f1Q60632 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2f1Q60632 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr2f1Q60632 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr2f1Q60632 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2f1Q60632 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr2f1Q60632 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2f1Q60632 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2f1Q60632 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr2f1Q60632 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2f1Q60632 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2f1Q60632 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2f1Q60632 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr2f1Q60632 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f1Q60632 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f1Q60632 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f1Q60632 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f1Q60632 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f1Q60632 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms