Protein–RNA interactions for Protein: Q60629

Epha5, Ephrin type-A receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha5Q60629 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha5Q60629 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha5Q60629 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha5Q60629 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epha5Q60629 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha5Q60629 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha5Q60629 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha5Q60629 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha5Q60629 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha5Q60629 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha5Q60629 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha5Q60629 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha5Q60629 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha5Q60629 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha5Q60629 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha5Q60629 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Epha5Q60629 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha5Q60629 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Epha5Q60629 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha5Q60629 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha5Q60629 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha5Q60629 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha5Q60629 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha5Q60629 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha5Q60629 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha5Q60629 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha5Q60629 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha5Q60629 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha5Q60629 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha5Q60629 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha5Q60629 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha5Q60629 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha5Q60629 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha5Q60629 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha5Q60629 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha5Q60629 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epha5Q60629 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha5Q60629 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epha5Q60629 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epha5Q60629 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epha5Q60629 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epha5Q60629 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epha5Q60629 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms