Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CttnQ60598 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CttnQ60598 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CttnQ60598 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CttnQ60598 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CttnQ60598 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CttnQ60598 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CttnQ60598 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CttnQ60598 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CttnQ60598 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CttnQ60598 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CttnQ60598 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CttnQ60598 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CttnQ60598 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CttnQ60598 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CttnQ60598 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CttnQ60598 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CttnQ60598 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CttnQ60598 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CttnQ60598 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CttnQ60598 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CttnQ60598 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CttnQ60598 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CttnQ60598 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CttnQ60598 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CttnQ60598 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CttnQ60598 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CttnQ60598 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CttnQ60598 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CttnQ60598 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CttnQ60598 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CttnQ60598 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CttnQ60598 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CttnQ60598 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CttnQ60598 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CttnQ60598 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms