Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arcn1Q5XJY5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arcn1Q5XJY5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arcn1Q5XJY5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arcn1Q5XJY5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arcn1Q5XJY5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arcn1Q5XJY5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arcn1Q5XJY5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arcn1Q5XJY5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arcn1Q5XJY5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arcn1Q5XJY5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Arcn1Q5XJY5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arcn1Q5XJY5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arcn1Q5XJY5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arcn1Q5XJY5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Arcn1Q5XJY5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arcn1Q5XJY5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arcn1Q5XJY5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arcn1Q5XJY5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arcn1Q5XJY5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arcn1Q5XJY5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arcn1Q5XJY5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arcn1Q5XJY5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arcn1Q5XJY5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arcn1Q5XJY5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arcn1Q5XJY5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arcn1Q5XJY5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arcn1Q5XJY5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arcn1Q5XJY5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arcn1Q5XJY5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arcn1Q5XJY5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arcn1Q5XJY5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Arcn1Q5XJY5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms