Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a6Q5U4D8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a6Q5U4D8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a6Q5U4D8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a6Q5U4D8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a6Q5U4D8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc5a6Q5U4D8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a6Q5U4D8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a6Q5U4D8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a6Q5U4D8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a6Q5U4D8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc5a6Q5U4D8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a6Q5U4D8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a6Q5U4D8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc5a6Q5U4D8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a6Q5U4D8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a6Q5U4D8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a6Q5U4D8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a6Q5U4D8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc5a6Q5U4D8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a6Q5U4D8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a6Q5U4D8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms