Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AbrQ5SSL4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AbrQ5SSL4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AbrQ5SSL4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AbrQ5SSL4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AbrQ5SSL4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AbrQ5SSL4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AbrQ5SSL4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AbrQ5SSL4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AbrQ5SSL4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AbrQ5SSL4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AbrQ5SSL4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AbrQ5SSL4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AbrQ5SSL4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AbrQ5SSL4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AbrQ5SSL4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AbrQ5SSL4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AbrQ5SSL4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AbrQ5SSL4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AbrQ5SSL4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AbrQ5SSL4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AbrQ5SSL4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AbrQ5SSL4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AbrQ5SSL4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AbrQ5SSL4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AbrQ5SSL4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AbrQ5SSL4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AbrQ5SSL4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AbrQ5SSL4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AbrQ5SSL4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AbrQ5SSL4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms