Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srek1ip1Q4V9W2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srek1ip1Q4V9W2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Srek1ip1Q4V9W2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srek1ip1Q4V9W2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srek1ip1Q4V9W2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srek1ip1Q4V9W2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srek1ip1Q4V9W2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srek1ip1Q4V9W2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srek1ip1Q4V9W2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms