Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ankrd53Q3V0J4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ankrd53Q3V0J4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ankrd53Q3V0J4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ankrd53Q3V0J4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ankrd53Q3V0J4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ankrd53Q3V0J4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ankrd53Q3V0J4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ankrd53Q3V0J4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd53Q3V0J4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd53Q3V0J4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd53Q3V0J4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd53Q3V0J4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd53Q3V0J4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms