Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Obox3Q3UT54 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Obox3Q3UT54 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Obox3Q3UT54 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Obox3Q3UT54 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Obox3Q3UT54 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Obox3Q3UT54 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Obox3Q3UT54 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Obox3Q3UT54 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Obox3Q3UT54 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Obox3Q3UT54 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Obox3Q3UT54 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Obox3Q3UT54 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Obox3Q3UT54 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Obox3Q3UT54 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Obox3Q3UT54 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1186.8 ms